S-R變異指新從患者分離的沙門菌常為光滑型，經(jīng)人工培養(yǎng)后菌落呈現(xiàn)粗糙型。常伴有抗原、毒力、某些生化特性的改變。

S-R變異指細(xì)菌菌落從光滑（smooth）的膨滑狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榇植诙櫩s的狀態(tài)，稱前者為S型，后者為R型。幾乎對(duì)所有的寄生細(xì)菌，當(dāng)將其從動(dòng)物體中分離轉(zhuǎn)入人工培養(yǎng)基中培養(yǎng)，尤其是移在液體培養(yǎng)基中進(jìn)行連續(xù)培養(yǎng)時(shí)，往往會(huì)看到這種現(xiàn)象。這種變化和其他方面的各種重要變化具有很密切的關(guān)系。

首先，細(xì)菌表面的物質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生變化，且相互連結(jié)，結(jié)果在培養(yǎng)液中容易凝聚而沉淀。例如在腸道細(xì)菌細(xì)胞壁上的聚脂多糖的O抗原側(cè)鏈消失并R核裸露出來(lái)時(shí)，便轉(zhuǎn)變?yōu)镽型。因此有關(guān)R核合成的基因群中任何一個(gè)基因發(fā)生變異都可成為R型細(xì)菌。具有明顯多糖莢膜的菌種（例如肺炎雙球菌）則同時(shí)伴有莢膜的消失，當(dāng)然由此所產(chǎn)生的特異性抗原也同時(shí)隨之消失。在細(xì)菌表面出現(xiàn)其他物質(zhì)，如蛋白性抗原非常明顯時(shí)，也可見(jiàn)到與其相應(yīng)的不同變異（例如 Streptococcus，脾脫疽菌）。如果是富于鞭毛的細(xì)菌，此時(shí)運(yùn)動(dòng)變?yōu)椴换顫?，甚至停止。如系病原菌，常常表現(xiàn)為毒性銳減，生化反應(yīng)也有變化。這些變化?？捎捎诟鞣N外在因素的存在而得到加強(qiáng)。例如Li 、酚、抗S血清，S型特異性噬菌體等的存在可導(dǎo)致代謝產(chǎn)物特別是氨基酸的積累而使上述變化受到阻抑。R→S的回復(fù)變異很難發(fā)生，一般是要通過(guò)動(dòng)物體后才會(huì)回復(fù)（R→S）?；蛟诮咏趧?dòng)物體的培養(yǎng)條件下給以R特異抗血清時(shí)才會(huì)出現(xiàn)回復(fù)變異。