一般在進(jìn)行提取、分離、精制過程中即可獲得對中藥化學(xué)成分的部分理化性質(zhì)（如酸堿性、極性、色譜行為及顯色反應(yīng)等）的認(rèn)識，文獻(xiàn)中有關(guān)其原植物或親緣植物成分的記述，進(jìn)行綜合分析，逐漸縮小范圍，有針對性的查對文獻(xiàn)，初步判斷化合物類型。中藥化學(xué)成分結(jié)構(gòu)研究一般主要包括以下程序和內(nèi)容。

1.化合物的純度測定

這是鑒定或測定其化學(xué)結(jié)構(gòu)的前提。化合物的純度測定一般常用各種色譜法，此外，固體物質(zhì)還可通過測定其熔點，考察其熔距的大小作為純度的參考。液體物質(zhì)還楞通過測定沸點、沸程、折光率及比重等判斷其純度。

2.物理常數(shù)測定

物理常數(shù)測定包括熔點、沸點、比旋度、折光率和比重等。

3.測定分子量、確定分子式、計算不飽和度

最常用的是質(zhì)譜法。高分辨質(zhì)譜法不僅可以給出化合物的精確分子量，還可以直接給出化合物的分子式。計算出化合物的不飽和度，推測出結(jié)構(gòu)中可能含有的雙鍵數(shù)或環(huán)數(shù)。

4.結(jié)構(gòu)骨架和官能團(tuán)的確定

通過化學(xué)分析方法、測定并解析化合物的有關(guān)波譜等，可確定分子的基本骨架以及含有的官能團(tuán)。

5.確定分子的平面結(jié)構(gòu)

綜合理化分析和各種波譜數(shù)據(jù)解析結(jié)果，推定化合物的分子平面結(jié)構(gòu)。

6.確定化合物的立體結(jié)構(gòu)

在以上研究的基礎(chǔ)上，根據(jù)具體需要情況，測定化合物圓二色譜、旋光譜、NOE譜、2D－NMR譜或進(jìn)行X線晶體衍射或進(jìn)行人工合成，推斷并確定化合物的立體結(jié)構(gòu)。