次要組織相容性抗原（mHA）一般僅引起較弱的排斥反應，但某些次要組織相容性抗原的組合能引起強而迅速的排斥反應。mHA是相對MHA而言的，究竟哪些基因編碼尚無定論醫(yī)學`教育網(wǎng)搜集整理。

次要組織相容性抗原包括非AB0血型抗原及性染色體相關抗原。例如男性Y染色體上有編碼次要組織相容性抗原的基因，稱為H-Y基因，女性受者可針對男性供者H-Y抗原產(chǎn)生排斥反應。另外，在不使用免疫抑制劑的情況下，即使主要組織相容性抗原完全相同的同胞兄弟姐妹間進行移植，仍會發(fā)生移植排斥，此乃由次要組織相容性抗原所引起，這些抗原可能定位在其他染色體上。由于組織配型技術的改進，在主要組織相容性抗原引起的排斥反應基本被控制后，次要組織相容性抗原引起的排斥反應將引起人們的關注。