成熟的、有功能的T細胞必須經過在胸腺中陽性選擇和陰性選擇。主要組織兼容性復合體（MHC）抗原在這兩種選擇中起著關鍵的作用。

　　⒈假如一個雙陽性細胞表面能與胸腺皮質上皮細胞表面MHCI類或Ⅱ類分子發(fā)生有效結合，就可能被選擇而繼續(xù)發(fā)育醫(yī)學教育|網，否則會發(fā)生程序性的細胞死亡（apoptosis）。MHCI類分子選擇CD8復合受體（coreceptor），而使同一個雙陽性細胞表面CD4復合受體減少；MHCⅡ類分子選擇CD4復合受體，而使CD8受體減少。這種選擇過程賦于成熟CD8 CD4-T細胞具有識別抗原多肽片段與自身MHcI類分子復合物的能力，CD4 CD8-T細胞具有識別抗原多肽片段與自身MHcⅡ類分子復合物的能力，成為T細胞MHC限制現象的基礎。

　　⒉陰性選擇過程（negative selection）　經過陽性選擇后的T細胞還必須經過一個陰性選擇過程，才能成為成熟的、具有識別外來抗原的T細胞。位于皮質與髓質交界處的樹突狀細胞（dendritic cell，DC）和巨噬細胞表達高水平的MHCI類抗原和Ⅱ類抗原，自身抗原成分與DC或巨噬細胞表面MHCI類或Ⅱ類抗原形成復合物。經過陽性選擇后的胸腺細胞如能識別DC或巨噬細胞表面自身抗原與MHC抗原復合物，即發(fā)生自身耐受（selftolerance）而停止發(fā)育，而不發(fā)生結合的胸腺細胞才能繼續(xù)發(fā)育為CD4 CD8-或CD4-CD8 單陽性細胞，離開胸腺遷移到外周血液中去。

　　機體的某些自身抗原可通過以下幾種方式來躲避免疫系統(tǒng)的識別，從而在胚胎期和出生后避免應答：⑴以一種免疫學上特免位置隱蔽起來，包括免疫屏障（immunological barrier）和隱蔽抗原（inaccessible antigens）；⑵自身抗原暴露在不表達MHC分子的細胞表面；⑶自身抗原濃度過低，不足于被T細胞所識別；⑷自身抗原與TCR、分子結合的親合力（avidity）還達不到T細胞有效刺激的水平。