一、細(xì)菌感染免疫學(xué)檢測(cè)

　　細(xì)菌感染后宿主體內(nèi)抗體的檢測(cè)方法有：輔助診斷腸熱癥的肥達(dá)試驗(yàn)，輔助診斷立克次體病的外斐試驗(yàn)，診斷鉤端螺旋體感染的顯微鏡凝集試驗(yàn)等直接凝集試驗(yàn)。酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)，膠乳凝集試驗(yàn)。

　　細(xì)菌抗原的測(cè)定方法有：凝集試驗(yàn)：玻片法凝集試驗(yàn)、膠乳凝集法、協(xié)同凝集試驗(yàn)、反向間接血凝試驗(yàn)。免疫熒光技術(shù)：直接法、間接法。莢膜腫脹試驗(yàn)。酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)。

　　非特異性凝集素的測(cè)定有：與原發(fā)性非典型性肺炎相關(guān)的冷凝集試驗(yàn)；用于診斷傳染性單核細(xì)胞增多癥的嗜異性凝集試驗(yàn)。

　　二、細(xì)菌感染的分子生物學(xué)檢測(cè)

　?。ㄒ唬┏Ｓ玫姆肿由飳W(xué)技術(shù)

　　1.核酸雜交 常用的雜交技術(shù)有：斑點(diǎn)雜交、southern印跡、原位雜交、Northern印跡等。探針的種類有全染色體DNA探針、染色體克隆片段DNA探針、質(zhì)粒DNA探針、rRNA基因探針、寡核苷酸探針等。

　　2.核酸擴(kuò)增技術(shù) 核酸擴(kuò)增技術(shù)是分子生物學(xué)中最具有重大意義的技術(shù)之一。對(duì)核酸進(jìn)行擴(kuò)增的方法很多，如聚合酶鏈反應(yīng)（polymerase chain reaction ,PCR）、連接酶鏈反應(yīng)、自保留序列擴(kuò)增及Q-beta擴(kuò)增等。以聚合酶鏈反應(yīng)最為廣泛應(yīng)用。

　　PCR技術(shù)在細(xì)菌的快速檢測(cè)、細(xì)菌的毒素基因檢測(cè)、細(xì)菌的耐藥性檢測(cè)及感染細(xì)菌的流行病學(xué)調(diào)查中得到日益廣泛的應(yīng)用。

　　生物芯片是新近發(fā)展的一項(xiàng)對(duì)基因、蛋白質(zhì)、細(xì)胞及其他生物組分進(jìn)行大信息量分析的檢測(cè)技術(shù)。常用的有基因芯片（gene chips）和蛋白芯片(protein chips)。目前正在研制和評(píng)價(jià)中。

　?。ǘ╄b定感染細(xì)菌種屬的方法

　　1.細(xì)菌種屬的鑒定

　　DNA堿基組成的測(cè)定 G+C mol%含量不同的細(xì)菌，為不同種細(xì)菌；含量相同的可能為不同種的細(xì)菌。細(xì)菌的G+C mol%相當(dāng)穩(wěn)定，不受培養(yǎng)條件、菌齡和其他外界因素影響。最常用的方法是熱變性法。

　　DNA-DNA雜交 DNA雜交可得出DNA之間核苷酸順序的互補(bǔ)程度，從而推斷不同細(xì)菌基因組間的同源性。

　　16S rRNA同源性分析 rRNA-DNA雜交、16S rRNA序列測(cè)定、16S-23S rRNA序列測(cè)定

　　此外限制性內(nèi)切酶長(zhǎng)度多態(tài)性分析（RFLP）、脈沖場(chǎng)凝膠電泳（PFGE）、隨機(jī)引物擴(kuò)增法（RAPD）等技術(shù)常用于菌株間的差異比較。

　　2.細(xì)菌種屬特異基因

　　某些基因?yàn)榧?xì)菌種特有或?qū)俟灿?，通過(guò)對(duì)這些基因的檢測(cè)可以鑒定細(xì)菌的種或?qū)?。如編碼吸附和侵襲上皮細(xì)胞表面蛋白的inv基因：invA、invB、invC、invD、invE等是一組只存在于致病性沙門菌中的獨(dú)特的保守基因序列。鞭毛蛋白dlh基因通常只存在于傷寒沙門菌；IS6110、IS986插入片段為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群所擁有等。

　　3.細(xì)菌毒力基因

　　可以測(cè)定霍亂弧菌的霍亂毒素基因、產(chǎn)腸毒素大腸埃希菌的耐熱（ST）和不耐熱腸毒素（LT）以及白喉棒狀桿菌的外毒素基因以示相應(yīng)的細(xì)菌存在。

　　（三）細(xì)菌耐藥性的分子生物學(xué)檢測(cè)

　　1.β內(nèi)酰胺類抗生素的耐藥基因

　　青霉素結(jié)合蛋白（PBP）基因 耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌是由mec A基因介導(dǎo)的耐藥，肺炎鏈球菌對(duì)青霉素耐藥是由于PBP基因突變而致。

　　革蘭陰性菌產(chǎn)生的β內(nèi)酰胺酶 由質(zhì)粒介導(dǎo)的β內(nèi)酰胺酶種類繁多，可以用PCR或基因探針的方法檢測(cè)和分類，如TEM、SHV、OXA、ROB型等。

　　2.糖肽類抗生素耐藥基因 腸球菌對(duì)糖肽類抗生素的耐藥基因由Van A、Van B、Van C等介導(dǎo)，測(cè)定這些基因可以預(yù)測(cè)對(duì)萬(wàn)古霉素和壁霉素的耐藥性。

　　3.大環(huán)內(nèi)酯類抗生素耐藥基因 紅霉素甲基酶erm基因、大環(huán)內(nèi)酯類泵出基因mef A、mef E、msr A等基因參與了紅霉素的耐藥。

　　4.喹喏酮類抗生素耐藥基因 喹喏酮類抗生素的主要耐藥機(jī)制是由于螺旋酶和拓?fù)涿傅耐蛔?，常與gyr和par基因突變有關(guān)。

　　5.分枝桿菌耐藥基因 對(duì)利福平的耐藥與rpoB變異有關(guān)，對(duì)異煙肼的耐藥與kat G和inh A有關(guān)。