先天性巨結(jié)腸的治療對于痙攣腸段短、便秘癥狀輕者，可先采用綜合性非手術(shù)療法，包括定時用等滲鹽水洗腸（灌洗出入量要求相等，忌用高滲、低滲鹽水或肥皂水），擴肛、甘油栓、緩瀉藥，并可用針灸或中藥治療，避免糞便在結(jié)腸內(nèi)淤積。若以上方法治療無效，雖為短段巨結(jié)腸亦應(yīng)手術(shù)治療。

　　凡痙攣腸段長，便秘嚴重者必須進行根治手術(shù)，目前采用最多的手術(shù)為：①拖出型直腸乙狀結(jié)腸切除術(shù)（Swenson術(shù)）；②結(jié)腸切除直腸后結(jié)腸拖出術(shù)（Duhamel手術(shù)）；③直腸粘膜剝離結(jié)腸于直腸肌鞘拖出切除術(shù)（Soave手術(shù)）。如患兒發(fā)生急性小腸結(jié)腸炎、危象或營養(yǎng)發(fā)育障礙，不能耐受一次根治手術(shù)者，醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理應(yīng)行靜脈補液輸血，改善一般情況后再行根治手術(shù)，如腸炎不能控制、腹脹嘔吐不止，應(yīng)及時作腸造瘺，以后再行根治術(shù)。