配對設計是將受試對象按配對條件配成對子，每對中的個體接受不同的處理。配對設計一般以主要的非實驗因素作為配比條件，而不以實驗因素作為配比條件。動物實驗中，常將同性別、同窩別、體重相近的兩個動物配成一對；人群試驗中，醫(yī).學教育網搜集整理常將性別和年齡、生活條件、工作條件相同或相近的兩個人配成對子，再按隨機化原則把每對中的受試對象分別分配到實驗組和對照組，或不同處理組。

　　此外，某些醫(yī)學實驗研究中的自身對照也可看作是配對設計，如某指標治療前后的比較；同一受試對象不同部位、不同器官的比較；同一標本不同檢測方法的比較。