首先，待測(cè)細(xì)胞經(jīng)處理或染色后被壓入流動(dòng)室，與此同時(shí)，不含細(xì)胞的緩沖液在高壓下從鞘液管噴出，鞘液管人口方向與待測(cè)樣品流成一定角度，這樣鞘液就能被包繞著樣品高速流動(dòng)，組成一個(gè)圓形的流束，待測(cè)細(xì)胞在包繞下單行排列，依次通過檢測(cè)區(qū)域。在激光束的照射下產(chǎn)生散射光和激發(fā)熒光。這兩個(gè)光源信號(hào)分別反映了細(xì)胞體積的大小和內(nèi)部的信息。經(jīng)光電倍增管接收后可轉(zhuǎn)換為電信號(hào)，再通過模，數(shù)轉(zhuǎn)換器。將連續(xù)的電信號(hào)轉(zhuǎn)換為可被計(jì)算機(jī)識(shí)別的數(shù)字信號(hào)，經(jīng)計(jì)算機(jī)處理，可將分析結(jié)果顯示在屏幕上。

為了保證細(xì)胞單個(gè)排列地逐一通過檢測(cè)區(qū)域，鞘流技術(shù)在流式細(xì)胞術(shù)中被廣泛應(yīng)用。根據(jù)層流理論，由于兩種液體的流速和壓力不同。在一定條件下樣品溶液與包裹它的鞘液在流動(dòng)中可以保持相互分離并且同軸。同時(shí)鞘液流可以加速樣品溶液中顆粒的流動(dòng)并迫使他們的流動(dòng)軌跡保持在液流的中軸線上，使細(xì)胞單排列地逐一通過檢測(cè)區(qū)域，這便是所謂的液流聚焦原理。