摘要】 目的:為了尋找腫瘤特異凋亡蛋白,克隆雞法氏囊組織中雞貧血病毒Apoptin蛋白的編碼基因并進(jìn)行序列分析。 方法:根據(jù)基因數(shù)據(jù)庫(kù)資料設(shè)計(jì)合成引物,以成雞法氏囊組織中提取的DNA作模板,通過PCR獲得了特異擴(kuò)增產(chǎn)物,將其插入到pGEMTeasy載體并轉(zhuǎn)染感受態(tài)E.coliDH5α菌株,提取質(zhì)粒經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切鑒定后,使用DNA測(cè)序儀測(cè)定插入片段的DNA序列。 使用DNAsis分析軟件分析所克隆的DNA序列及其編碼蛋白質(zhì),并與數(shù)據(jù)庫(kù)中Apoptin蛋白的編碼基因相比較。 結(jié)果:序列分析表明,成功地克隆了雞貧血病毒的Apoptin基因,同基因數(shù)據(jù)庫(kù)中的相關(guān)資料比較發(fā)現(xiàn)與山東報(bào)道的Apoptin基因(GenBank AY171617)的核酸序列一致,同雞貧血病毒全基因序列中的Apoptin序列(GenBank AF 313470)有6個(gè)核酸差異。 結(jié)論:Apoptin編碼基因的克隆為特異誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡治療腫瘤奠定了基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】 雞貧血病毒 凋亡素 克隆 測(cè)序
0.引言
雞貧血病毒(chicken anemia virus, CAV)是由DanenVan Oorschot等[1]在1979年發(fā)現(xiàn)并能引起雛雞貧血死亡的一種環(huán)狀病毒。CAV基因組長(zhǎng)度約2.3 kb[2],能分別編碼VP1,VP2和VP3三種蛋白質(zhì)。 其中VP3蛋白是功能蛋白質(zhì),由121個(gè)氨基酸組成,它包含兩個(gè)富含脯氨酸的序列和兩個(gè)帶正電的區(qū)域,具有誘導(dǎo)被感染雞血細(xì)胞凋亡的活性,是雞貧血病毒的主要致病因子,根據(jù)此特性將該蛋白命名為凋亡素(Apoptin)[3]。 在Apoptin誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡的作用機(jī)制研究方面已取得較大進(jìn)展[4], Apoptin能特異性誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞和轉(zhuǎn)化細(xì)胞調(diào)亡,其發(fā)生作用不依賴p53基因,而且不被Bcl2過表達(dá)所抑制,因此這種Apoptin可能成為一種很有前途的能選擇性地誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞和轉(zhuǎn)化細(xì)胞發(fā)生凋亡的藥物。
本研究旨在從自然生長(zhǎng)的家雞法氏囊中分離、提取CAV DNA,通過PCR方法擴(kuò)增CAV的Apoptin編碼基因,將其插入克隆載體PGEMT中,使用雙脫氧終止法測(cè)定插入片段的DNA序列,同Genbank的數(shù)據(jù)庫(kù)比較證實(shí)獲得了CAV的Apoptin編碼基因克隆,為研究Apoptin治療腫瘤奠定了基礎(chǔ)。
1.材料和方法
1.1材料4只低體質(zhì)量(<1400 g),低產(chǎn)卵的3月齡雌雞(購(gòu)于西安市郊區(qū)某雞場(chǎng));PGEMT質(zhì)粒、E.coliDH5α(西安市華廣生物工程有限公司實(shí)驗(yàn)室提供)。 耐熱的TaqDNA聚合酶、各種限制性內(nèi)切酶、DNA聚合酶、T4 DNA連接酶、蛋白酶K, DNA Mr標(biāo)準(zhǔn),華美生物公司;E.coliDH5α受體菌,華廣生物工程公司。
1.2方法
1.2.1病毒DNA提取將雞頸靜脈放血處死,立即分離法氏囊,置液態(tài)氮冷凍保存;取100 mg冷凍組織,在1 mL的勻漿緩沖液(50 mmol/L TrisHCl, 100 mmol/L NaCl, 2 mmol/L EDTA, pH 8.0)中制備組織勻漿;取500 μL勻漿加入SDS和蛋白酶K,使其終濃度分別為1和200 mg/L,37℃溫育120 min消化組織蛋白,消化后加入等體積的酚和氯仿/異戊醇各抽提一次,收集上清液加入RNase,37℃溫育60 min,再次用酚和氯仿/異戊醇各抽提,加入二倍無水乙醇沉淀,收集沉淀使用700 mL/L乙醇洗滌后干燥,使用100 μL TE緩沖液溶解備用。
1.2.2引物的設(shè)計(jì)根據(jù)GenBank發(fā)表的CAV基因序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物。 正向引物5′CGG CCG GCG TGG GAT GAA CGA TCT CCA AGA AGA TAC3′, 反向引物5′CAA GCT TCA GTC TTA TAC GCC TTC TTG CGG TTC3′。 粗斜體表示在正向引物和反向引物的5′端加入的Nae I 和Hind III酶切位點(diǎn),在正向引物和反向引物中分別加入了CG和C保護(hù)堿基。 為了作Apoptin同相關(guān)蛋白的融合表達(dá)在反向引物3′端刪除了終止子。
1.2.3PCR反應(yīng)將上述目的基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)參數(shù)為:94℃ 5 min預(yù)變性, 94℃ 60 s, 60℃ 60 s, 72℃ 90 s,循環(huán)30次后,72℃延長(zhǎng)5 min;PCR產(chǎn)物的鑒定與回收及同線性載體pGEMT連接、受體菌的轉(zhuǎn)化按常規(guī)分子生物學(xué)方法進(jìn)行。
1.2.4陽性重組子的篩選與鑒定轉(zhuǎn)化菌涂在含氨芐青霉素的加入X gal和IPGT的LB平板上,挑取白色菌落,擴(kuò)增后提取質(zhì)粒,EcoR I酶切后,瓊脂糖凝膠電泳。
1.2.5序列比較分析選取陽性重組克隆,由上?;倒編椭鷾y(cè)定插入片段序列。 插入片段同CAV Apoptin基因序列的一致性和編碼蛋白質(zhì)的分析使用DNAsis 2.5軟件完成。[醫(yī) 學(xué)教育網(wǎng) 搜集整理]
2.結(jié)果
2.1PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(366 bp)與目的片斷相吻合(圖1)。
2.2重組質(zhì)粒pGEMT/Apoptin的酶切鑒定重組質(zhì)粒pGEMT/Apoptin經(jīng)EcoRⅠ酶切瓊脂糖凝膠電泳得到2659 bp和約400 bp(393 bp)的兩片段, 后者與目的片斷大小一致(圖2)。
2.3重組pGEMT/Apoptin質(zhì)粒中的Apoptin基因測(cè)序?qū)Λ@得的重組質(zhì)粒進(jìn)行DNA序列測(cè)定,測(cè)定的結(jié)果表明插入片段與設(shè)計(jì)片段序列完全一致,無堿基突變和讀碼框移位。
2.4克隆Apoptin編碼基因分析同GenBank AF 313470比較,本研究克隆的CAV Apoptin基因序列有6個(gè)核酸變異;同文獻(xiàn)報(bào)道的Apoptin基因序列AY171617一致。
3.討論
Apoptin是CAV的VP3蛋白基因編碼的一種蛋白質(zhì),這種蛋白能特異性地誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞和轉(zhuǎn)化細(xì)胞調(diào)亡,因此人們也稱其為凋亡素-Apoptin,其發(fā)生作用不依賴p53基因,也不能被Bcl2過表達(dá)所抑制,有可能成為研究腫瘤細(xì)胞凋亡和抗腫瘤藥物很有用的一個(gè)靶分子。[醫(yī)學(xué)教育網(wǎng) 搜 集整理]
為了證實(shí)克隆的基因是否為Apoptin基因,將其與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中相關(guān)基因進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中登錄的46株CAV的VP3基因的同源性至少為98%,證實(shí)了克隆的DNA片段確為Apoptin基因。 同時(shí)將克隆的VP3基因ORF推導(dǎo)得到的蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中相關(guān)蛋白質(zhì)進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的29株CAV的凋亡素氨基酸序列的同源性至少為82%. CAV是一種比較保守的病毒[5],目前僅發(fā)現(xiàn)一種血清型。 凋亡素分子的118位氨基酸,所有報(bào)道的序列中幾乎一半為Cys,一半為Arg. 實(shí)驗(yàn)證明,這一變化對(duì)凋亡素活性影響似乎比較大,當(dāng)這個(gè)位點(diǎn)的Arg變成Cys時(shí),CAV在傳代細(xì)胞中的傳代效率降低,而且將降低凋亡素的核定位能力,表現(xiàn)為存留在胞質(zhì)中的凋亡素量將超過細(xì)胞核的量,進(jìn)而將降低其誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡活性。 我們克隆的VP3基因編碼的蛋白質(zhì)是118 Arg,因此可能具有較強(qiáng)的誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡的活性。 凋亡素可能是通過一種與大多數(shù)功能蛋白質(zhì)不同的作用機(jī)制來發(fā)揮其誘發(fā)腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡作用的,凋亡素在發(fā)揮功能時(shí)可能并不以單體的形式存在,而是與其他成分結(jié)合,或與自身成分形成異源或同源多聚體來發(fā)揮其功能。 Leliveld等[6]將麥芽糖結(jié)合蛋白(maltose bindingprotein, MBP)與凋亡素分子連接,構(gòu)建了一個(gè)可溶性的重組凋亡素蛋白融合體(MBPApoptin),經(jīng)反復(fù)試驗(yàn)證明MBPApoptin是一個(gè)由30~40個(gè)亞基組成的穩(wěn)定、均一在體內(nèi)有活性的球形多聚體復(fù)合物;Zhang等[7]通過顯微注射手段將MBPApoptin分別注射到腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞中,結(jié)果證實(shí)MBPApoptin在腫瘤細(xì)胞中具有顯著的效價(jià)和特異性,而在正常細(xì)胞中細(xì)胞抗原表位被保護(hù),MBPApoptin匯集成高級(jí)聚集體,最終在細(xì)胞質(zhì)中被蛋白酶降解而消失[8]。 由于VP3基因編碼的凋亡素蛋白Apoptin具有很高選擇性,這些特性進(jìn)一步增強(qiáng)了凋亡素作為抗腫瘤藥物的安全性。 從而有望解決腫瘤治療中高效性和特異性難于統(tǒng)一及易產(chǎn)生耐藥性等難題。 Apoptin將是一種非常有前景的抗腫瘤制劑,它的開發(fā)利用必將會(huì)產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。
【參考文獻(xiàn)】[1] DanenVan Oorschot AA, van Der Eb AJ, Noteborn MH. The chicken anemia virusderived protein apoptin requires activation of caspases for induction of apoptosis in human tumor cells[J]。 J Virol, 2000, 74(15): 7072-7078.
?。?] Phenix KV, Meehan BM, Todd D, et al. Transcriptional analysis and genome expression of chicken anemia virus[J]。 J Gen Virol, 1994, 75(Pt 4): 905-909.
?。?] Noteborn MH, Todd D, Verschueren CA, et al. A single chicken anemia virus protein induces apoptosis [J]。 J Virol, 1994, 68(1): 346-351.
[4] DanenVan Oorschot AA, Zhang YH, Leliveld SR, et al. Importance of nuclear localization of apoptin for tumorspecific induction of apoptosis [J]。 J Biol Chem,2003,278(30):27729-27736.
[5] Zhang YH, Kooistra K, Pietersen A, et al. Activation of the tumorspecific death effector apoptin and its kinase by an Nterminal determinant of simian virus 40 large Tantigen [J]。 J Virol, 2004, 78(18): 9965-9976.
?。?] Leliveld SR, Dame RT, Mommaas MA. Apoptin protein multimers form distinct higherorder nucleoprotein complexes with DNA[J]。 Nucleic Acids Res, 2003,31(16):4805-4813.
?。?] Zhang YH, Leliveld SR, Kooistra K, et al. Recombinant Apoptin multimers kill tumor cells but nontoxic and epitope shielded in a normal cell specific fashion [J]。 Exp Cell Res,2003,289(1):36-46.
?。?] Pietersen AM, Vander Eb MM, Rademaker HJ, et al. Specific tumor cell killing with adenovirus vectors containing the apoptin gene[J]。Gene Ther,1999,6(5):882-892。