近日,我所張立華博士在《Disease Markers》雜志發(fā)表一篇名為“Identification of common genes refer to colorectal carcinogenesis with paired cancer and non-cancer samples” 的文章,周宏灝院士為文章通訊作者。
結(jié)直腸癌在全世界范圍內(nèi)發(fā)病率和死亡率均較高的惡性腫瘤。結(jié)直腸癌發(fā)生病因有很多,比如遺傳因素、飲食因素、腸炎和息肉等。在分子水平,結(jié)直腸癌也是一種異質(zhì)性很強(qiáng)的惡性腫瘤,直到目前,結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制仍舊不明確。
為了進(jìn)一步探究人類結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的共性分子機(jī)制,本研究從公共數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI-GEO出發(fā),下載并分析了3個(gè)配對(duì)的結(jié)直腸癌和非癌組織樣本表達(dá)譜數(shù)據(jù)集(GSE21510,23對(duì);GSE23878,17對(duì)樣本;GSE32323,19對(duì)樣本),以非癌組織為對(duì)照,分別對(duì)癌組織中表達(dá)上調(diào)和下調(diào)基因進(jìn)行篩選。并將三個(gè)數(shù)據(jù)集的上調(diào)和下調(diào)差異顯著基因取交集,得到181個(gè)共同上調(diào)基因和282個(gè)共同下調(diào)基因,對(duì)這些基因進(jìn)行pathway和GO分析后,取MCM2,RNASEH2A,TOP2A共3個(gè)上調(diào)基因在16對(duì)結(jié)直腸癌和癌旁組織中進(jìn)行熒光定量PCR實(shí)驗(yàn),證實(shí)了三個(gè)基因在結(jié)直腸癌組織中高表達(dá)。以上研究為表達(dá)譜水平闡明結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制提供了依據(jù)。
原文鏈接:
https://www.hindawi.com/journals/dm/2018/3452739/
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