菘藍是二年生草本。主根深長，直徑5～8毫米，外皮灰黃色。莖直立，高40～90厘米。葉互生；基生葉較大，具柄，葉片長圓狀橢圓形；莖生葉長圓形至長圓狀倒披針形，在下部的葉較大，漸上漸小，長3.5～11厘米，寬0.5～3厘米，先端鈍尖，基部箭形，半抱莖，全緣或有不明顯的細鋸齒。闊總狀花序：花小，直徑3～4毫米，無苞，花梗細長；花萼4，綠色；花瓣4，黃色，倒卵形；雄蕊6，4強；雌蕊1，長圓形。長角果長圓形，扁平翅狀，具中肋。種子1枚。花期5月。果期6月。