在生產(chǎn)上常見的雜菌，感染段木的主要有棉腐菌、裂褶菌、云芝、木霉等；為害子實體的，主要有青霉、木霉、織殼霉（俗稱白粉?。?、紅酵母等。其中以織殼霉最常見，為害最嚴重，發(fā)病的耳片形成一層粉狀物，并使子實銀耳體僵化。防治上以 抓好栽培場所的清潔衛(wèi)生和通風換氣為主，防止或減少病害發(fā)生。對發(fā)病嚴重的子實體應及時摘除，然后再噴石硫合劑進行控制。耳木污染其他雜菌對應及時刮除刷洗，然后用石灰水消毒，置陽光下曬1～2天再恢復管理。

常見的害蟲有線蟲、螨類、菌蠅、蛞蝓等，其中線蟲是引起爛耳的主要蟲害，侵害耳基使耳片得不到營養(yǎng)而腐爛。在預防上，用水要干凈，防止水中帶有線蟲，段木勿沾泥土，防止線蟲入侵。對已發(fā)生的爛耳，應及時刮除，并用清水刷洗，防止蔓延。藥物防治可用1%醋酸或稀釋4倍的醋，或0.1%～0.2%敵百蟲噴射耳木，可以抑制線蟲的繁殖。螨類也是銀耳的主要蟲害。繁殖極快，常蛀食菌絲和耳根，發(fā)生后，應用0.5%的敵敵畏噴灑耳場并用1：800倍的20%可濕性殺螨砜浸濕耳木（浸后立即取出）或噴濕耳木進行防治。也可用800倍的樂果或敵百蟲噴殺。