分離方法：

目前胚胎干細胞來源主要是胚泡內細胞群和生殖嵴中的原始生殖細胞

免疫學方法：干細胞表面有許多特殊標記，利用這些標記，采用熒光細胞分離器從單細胞懸液中的分離純化干細胞。

免疫外科方法：該方法基本原理是利用囊胚腔對抗體的不通透性，通過抗體、補體結合對細胞的毒性殺傷作用，去除滋養(yǎng)層細胞，保留CIM進行培養(yǎng)。

組織培養(yǎng)：將4-6天的胚胎取出培養(yǎng)，滋養(yǎng)層在培養(yǎng)皿底部平鋪生長，而CIM形成卵圓柱裝結構，在顯微鏡下用玻璃針挑出這種柱狀結構，消化傳代

顯微外科學法：利用顯微鏡直接將CIM從胚泡中吸出進行培養(yǎng)。

鑒定方法：

1形態(tài)學檢測：體積小、核大、核質比高，一個或多個突起的核仁，常染色質，胞質少、結構簡單。

體外培養(yǎng)：細胞排列緊密，集落狀生長。堿性磷酸酶染色，細胞呈棕紅色，周圍成纖維細胞淡黃色。細胞克隆與周圍界限明顯，細胞克隆間界限不清、形態(tài)多樣，多數呈島狀或巢狀。

2堿性磷酸酶活性的檢測——染色后呈深藍紫色

3體內分化實驗：畸胎瘤

4體外分化實驗：囊狀簡單胚體或類胚體，常見多種類型細胞混雜在一起

5核型分析法：二倍體正常核型

6OCT活性檢測： 多能性基因標志。OCT抗血清和間接免疫熒光法檢測OCT基因表達產物

ES細胞應用：

（1）ES細胞的應用前景

1.動物克隆及人類治療性克隆

2.在轉基因動物中的應用

3.制備嵌合體動物

（2）ES細胞研究面臨的難題

1.體外培養(yǎng)ES細胞需篩選適宜的培養(yǎng)條件，平衡增殖和分化之間的矛盾

2.高度未分化，具形成畸胎瘤的可能性

3.真正用于器官克隆與移植仍需技術上的突破

4.倫理學