和多數β-內酰胺類抗生素一樣，由于藥物的相互作用，頭孢吡肟溶液不可加至甲硝唑，萬古霉素，慶大霉素，妥布霉素或硫酸奈替米星，氨茶堿溶液中。頭孢吡肟濃度超過40mg/ml時，不可加至氨芐青霉素溶液中。如有與頭孢吡肟合用的指征，這些抗菌素應與頭孢吡肟分開使用。

頭孢吡肟可引起尿糖試驗假陽性反應。建議使用該品治療期間，使用葡萄糖氧化酶反應檢測方法。