凡侵入人體后大部分時間停留在宿主細胞內并繁殖的病原菌稱胞內寄生菌。例如結核桿菌、麻風桿菌、布氏桿菌等均屬此類。由于抗體不能進入細胞內，所以體液免疫對這類細菌感染的作用受到限制，對胞內感染的防御功能主要靠細胞免疫。醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理例如機體初次感染結核桿菌，由于細胞免疫尚未建立，吞噬細胞雖可將它們吞噬，但不能有效地消化殺滅，因此病原菌容易隨吞噬細胞在體內擴散，蔓延，而造成全身感染。但在傳染過程中，機體在病原菌的刺激下逐漸形成細胞免疫，通過致敏淋巴細胞釋放的各種淋巴因子，激活吞噬細胞，可大增強其吞噬消化能力，抑制病原菌在吞噬細胞內生存，從而獲得防御同種病種原菌再感染的免疫力。