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    計(jì)算基因組學(xué)研究方面獲新進(jìn)展

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      近日,上海交通大學(xué)張大兵教授指導(dǎo)的博士生王叢茂在基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)的壓縮研究上獲得新突破。該項(xiàng)研究建立了一種新的基于參考基因組序列的個(gè)體基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)的壓縮方法GRS,改變了現(xiàn)有個(gè)體基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)的壓縮管理方法;為研究基因組SNPs,Indels及SVs提供了更好的計(jì)算思路,并且為基于染色體水平的計(jì)算分子進(jìn)化和比較基因組學(xué)的發(fā)展提供了借鑒意義。該論文發(fā)表在分子生物學(xué)領(lǐng)域的著名刊物《Nucleic Acids Research》上。

      王叢茂是2008年上海交通大學(xué)跨學(xué)科招生錄取的學(xué)生,該同學(xué)在本科階段學(xué)習(xí)的自動(dòng)化控制專(zhuān)業(yè)基礎(chǔ)上,結(jié)合生命科學(xué)研究特點(diǎn),開(kāi)展生物信息交叉科學(xué)學(xué)習(xí)和研究工作,在此次文章發(fā)表之前,王叢茂同學(xué)開(kāi)發(fā)了一套適合雙端高通量測(cè)序技術(shù)的染色質(zhì)免疫沉淀-測(cè)序(CHIP-Seq)DNA-蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)的計(jì)算方法,并以第一作者身份在生物信息領(lǐng)域高質(zhì)量期刊《BMC Bioinformatics》上發(fā)表了這個(gè)結(jié)果醫(yī)學(xué)`教育網(wǎng)搜集整理。

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