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近日,上海交通大學(xué)張大兵教授指導(dǎo)的博士生王叢茂在基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮研究上獲得新突破。該項研究建立了一種新的基于參考基因組序列的個體基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮方法GRS,改變了現(xiàn)有個體基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮管理方法;為研究基因組SNPs,Indels及SVs提供了更好的計算思路,并且為基于染色體水平的計算分子進(jìn)化和比較基因組學(xué)的發(fā)展提供了借鑒意義。該論文發(fā)表在分子生物學(xué)領(lǐng)域的著名刊物《Nucleic Acids Research》上。
王叢茂是2008年上海交通大學(xué)跨學(xué)科招生錄取的學(xué)生,該同學(xué)在本科階段學(xué)習(xí)的自動化控制專業(yè)基礎(chǔ)上,結(jié)合生命科學(xué)研究特點,開展生物信息交叉科學(xué)學(xué)習(xí)和研究工作,在此次文章發(fā)表之前,王叢茂同學(xué)開發(fā)了一套適合雙端高通量測序技術(shù)的染色質(zhì)免疫沉淀-測序(CHIP-Seq)DNA-蛋白質(zhì)結(jié)合位點的計算方法,并以第一作者身份在生物信息領(lǐng)域高質(zhì)量期刊《BMC Bioinformatics》上發(fā)表了這個結(jié)果醫(yī)學(xué)`教育網(wǎng)搜集整理。
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