天然存在的糖醛酸有D-葡糖醛酸、D-半乳糖醛酸、D-甘露糖醛酸等，以與糖苷配基結合的糖醛酸苷（ur－onide）形式或聚糖醛酸的形式，成為樹膠質、果膠、半纖維素、藻酸、細菌多糖等細胞壁或粘液物質的主要成分。D-葡糖醛酸在動物體內具有與毒物結合（葡糠醛酸結合作用）后排出的作用，也是構成肝素、硫酸軟骨素、透明質酸等高活性物質的成分。這樣，糖醛酸不是以游離單糖存在，而是以苷或多糖的形態(tài)存在于生物體內，它的生物合成是這樣進行的：在UDP葡萄糖的酶促氧化反應中生成的UDP葡糖醛酸（UDP glucuronic acid）作為前體，在特異的轉移酶的催化下D-葡糖醛酸殘基轉移到糖苷配基或其它糖鏈的非還原性末端，形成糖醛酸苷鍵。醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理認為D-半乳糖醛酸、D-甘露糖醛酸、L-艾杜糖醛酸等是在核苷酸糖的階段或多糖鏈階段，由差向異構酶的反應形成的，但實驗證據(jù)不一定充足。另一方面，在生物體內也廣泛分布著特異的水解糖醛酸苷鍵的酶（β-葡糖苷酸酶）。